يظن البعض ان المعامل تقوم باستخدام ماء الصنبور (مياه البلدية) فى اجراء التجارب المختلفة، ولكن الحقيقة عكس ذلك حيث أنه لا يتم استخدام مياه الصنبور بسبب أن هذه المياه قد تحتوى على بعض الشوائب والمركبات العضوية بالاضافة الى الحمل الميكروبى المتنوع، لذا لا يتم استخدام مياه الصنبورمباشرة فى اجراء الاختبارات لأنه قد يؤدى إلى نتائج خاطئة، وعلاوة على ذلك فإنه يمكن أيضا أن يقلل العمرالافتراضي لبعض الأجهزة الحساسة الموجودة بالمعامل.
الماء يعتبر مذيب عام، وهذا يجعل الماء عرضة للتلوث من مصادر مختلفة، لذلك قامت الجمعية الأمريكية للاختبار والمواد (ASTM)وايضاً منظمة الايزو وكذلك معهد المعايير الطبية والمخبرية CLSI)) بوضع مواصفات خاصة بالمياه المستخدمة فى اجراء الاختبارات بالمعامل طبقاً لدرجة نقاوة الماء وخلوه من الشوائب بعد اجراء عدة عمليات تنقية مختلفة للمياه لتحقيق مستويات متنوعة من النقاء لتتحول المياه العادية إلى مياه بدرجة الكواشف Reagent grade water.
وهناك طرق عديدة لتقسيم الماء حسب نقاوته طبقاً للمواصفات المطلوبة وأبسطها التقسيم طبقاً للاستخدام الى ثلاثة انواع كالتالى :
مياه من النوع الأول Type I Water
وهو الماء فائق النقاء Ultrapure Water
ويستعمل هذا الماء فى العمليات الحساسة بالمعامل مثل زراعة الانسجة وكذلك ايضاُ مع الاجهزة الدقيقة مثل جهاز HPLC
مياه من النوع الثانى Type II Water
وهو الماء النقى pure Water
ويستعمل فى الاستخدامات العامة للمعامل مثل تحضير الأوساط الغذائية للبكتيريا
مياه من النوع الثالث Type III Water
مياه ذات جودة أولية
وتستعمل فى الاعمال الغير هامة مثل غسل الادوات و وشطف الأدوات الزجاجية او ملء الحمام المائى